Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops6O88545 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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