Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms