Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms