Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BckdkO55028 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BckdkO55028 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms