Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
E2f6O54917 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms