Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TsksO54887 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms