Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Psmb10O35955 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Psmb10O35955 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms