Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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