Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ptpn9O35239 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ptpn9O35239 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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