Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms