Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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