Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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