Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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