Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3336J3QMQ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms