Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21060J3KMU4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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