Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm17535J3KMR8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm17535J3KMR8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms