Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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