Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm20828J3KMI7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20828J3KMI7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20828J3KMI7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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