Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn20G5E8X0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn20G5E8X0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn20G5E8X0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn20G5E8X0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn20G5E8X0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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