Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms