Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp32F8VPZ3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp32F8VPZ3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms