Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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