Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-M1F7CXU4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms