Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ccdc33-203ENSMUST00000098682 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Celf2-213ENSMUST00000150624 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 A3galt2-201ENSMUST00000030585 3390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms