Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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