Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3250E9Q1M3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms