Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc1E9Q043 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms