Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc8E9PWG2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms