Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gcn1E9PVA8 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gcn1E9PVA8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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