Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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