Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Phf11bB4XVQ1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Phf11bB4XVQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Phf11bB4XVQ1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Phf11bB4XVQ1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms