Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms