Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atp8b5A3FIN4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms