Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rtf1A2AQ19 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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