Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syndig1A2ANU3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms