Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm12A2AJ77 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prdm12A2AJ77 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms