Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lrit3W8DXL4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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