Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17190V9GX38 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms