Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Krt27Q9Z320 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms