Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac5Q9Z2V6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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