Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vamp5Q9Z2P8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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