Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Crlf3Q9Z2L7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms