Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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