Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn5Q9WU28 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms