Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trpc2Q9R244 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms