Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim44Q9QXA7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim44Q9QXA7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim44Q9QXA7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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