Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptf1aQ9QX98 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptf1aQ9QX98 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms