Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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