Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms