Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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